La succession du génome de Naegleria aide à comprendre comment a été le premier eucariota, à borner le génome minimal et à analyser les routes métaboliques exotiques qui de plus peut-être peuvent servir des sources d'énergie.

Naegleria dans une phase flagellée. Une fontaine : Lillian Fritz-Laylin, UC Berkeley.
L'importance scientifique d'une découverte ou son importance mediática parfois ils ne coïncident pas. La découverte d'un nouveau fossile de dinosaure, avec ou sans plumes, a l'habitude d'avoir un certain impact mediático. Mais les dinosaures, si cinématographiques ils, ne sont pas nos aïeux biologiques, ils ne devraient pas avoir tant d'importance, bien qu'ils excitent notre imagination. Même la faune de Burguess Shale, avec ses créatures étrangères, ils n'ont pas l'habitude d'importer beaucoup, bien qu'elle soit racontée par la prose magnifique de Steven J. Gould. C'est pourquoi, si nous nous élevons encore plus en arrière dans le temps, et nous parlons des microorganismes, il est normal que les gens avec peu de préoccupations passent du sujet dans une question.
Mais les microorganismes sont les rois de la création. Ils ont été les habitants uniques de cette planète pendant des milliers de millions d'années et, encore aujourd'hui, la vie à la Terre serait impossible sans ceux-ci. Ce sont à peu près que des attachés des microorganismes sophistiqués. Dans chaque cellule de notre corps, elles vivent encore dans endosimbiosis, les mitocondrias, quelques bactéries dégénérées qui nous fournissent une énergie. Même en ignorant il est fait, vous, un ami lecteur, il a dans son corps 10 bactéries à chaque cellule somatique.
L'histoire de la vie est une longue histoire, avec des événements uniques, les événements fondamentaux qui l'ont changée pour toujours. L'une de ces transitions a été le pas de cellules procariotas sans noyau, comme les bactéries et tu arques, à des cellules eucariotas nucléaires. On croit que cet événement est arrivé environ 1500 millions d'années. Presque nous n'avons pas de restes fossiles de cette époque, dès que nous elle avons à nous arranger à vérifier qu'il a passé. L'une des manières est de regarder dans des génomes d'espèces distinctes. Dans ces livres génétiques une partie de cette histoire est racontée si nous faisons un exercice “d'une littérature comparative”. C'est l'une des raisons par lesquelles des séquences organismes : pour plus savoir sur le passé.
L'un des génomes récemment secuenciado est celui de Naegleria gruberi. Cette créature est assez propre du point de vue biologique et son génome peut nous aider à comprendre la transition de procariotas à eucariotas.
Le travail, ils ont porté à un terme, les hommes de science du Department of Energy Joint Genome Institute (JGI) de l'Université de Berkeley et les experts de l'Université de Lancaster en Royaume-Uni.
Naegleria est une amibe commune du sol qui se consacre à la chasse de bactéries. Les exemplaires secuenciados se sont isolés, dans ce cas, de la boue d'une futaie d'eucalyptus dans le campus de l'Université de Berkeley. Quand cet organisme se trouve sous stress ils lui grandissent, les fouets, qui sont orgánulos similaires à celui des spermatozoïdes, et il se met à nager en recherche de meilleurs territoires. De plus, il a une troisième identité; si les conditions du sol deviennent très dures, de l'époque il se transforme en kyste dur et attend de meilleurs temps.
Selon Simon E. Prochnik, un processus comme celui-ci de se transformer en flagellé à partir de l'état ameboideo est très rare.

Une microphotographie par une microscopie électronique de balayage (une gauche) de la phase de kyste de
Naegleria. À la phase droite ameboidea du même microorganisme. Une fontaine : Lillian Fritz-Laylin, UC Berkeley.
Prochnik et ses collaborateurs ont découvert que cet organisme a, logiquement, des paquets de gènes consacrés à toutes ces "personnalités". Son génome contient pas moins de 15.727 gènes codificateurs de protéines, que c'est un nombre comparable avec 23.000 chez des humains.
La raison à laquelle Naegleria a tant de gènes découle de son style de vie compliqué. La majorité des organismes unicelulares ont peu de gènes. Selon Prochnik, à l'être un organisme si versatile, son génome doit contenir l'information nécessaire pour survivre dans la variété d'atmosphères dans lesquelles il le fait et sous les gammes distinctes du stress qu'il est soumis.
Ces enquêteurs ont comparé le génome de Naegleria au génome 16 eucariotas qui allaient des champignons aux humains en passant par des plantes et des protozoaires. Un organisme libre le non parasite, qui n'a pas perdu une partie de ses gènes et de fonctions, a permis une plus vaste comparaison à l'être et il permet de trouver plus de protéines qui étaient dans les eucariotas ancestraux. Ils ont identifié l'ensemble de 4000 gènes qui, selon ces hommes de science, est probablement partie du génome le plus primitif eucariota.
Le nombre opposé de gènes ont surpris les enquêteurs parce que dans les comparaisons préalables, qui incluaient aux microorganismes des parasites, il a passé par un nombre inférieur, probablement à cause que les parasites délèguent une partie de ses fonctions aux gènes de l'être qui les loge. Ce résultat peut aider à déterminer, donc, le nombre minimal de gènes qui permettent une vie indépendante.
C'est la première génétique comparative qu'il inclut pas seulement à Naegleria, mais de plus à des représentants des six groupes d'eucariotas secuenciados, comme chromalveolata, diatomeas, le microorganisme causant de la malaria, les microbes de marée rouge, d'amibes ou de parasites comme giardia.
Entre d'autres résultats intéressants de cette étude il est qu'il peut aider à jeter une lumière sur comment les cellules se sont déplacées, comment les unes envoient des signes aux autres ou comment ils métabolisent des nutriments.
Naegleria use pseudópodos dans sa phase ameboidea dans ses déplacements pour chasser des bactéries, mais quand la nourriture disparaît il développe des fouets depuis “la rien” et les utilise pour nager à de meilleurs territoires de chasse. Mais les pseudópodos et les fouets utilisent différentes protéines pour le mouvement. Le premier basé dans actina qui crée un échafaudage à l'intérieur de la cellule. Le deuxième est basé sur le tubulina. Comme cet organisme a les deux systèmes il peut aider les hommes de science à comprendre l'origine de ce système parallèle pendant l'évolution des eucariotas.
Quand les hommes de science ont soumis des populations de Naegleria à un manque d'aliment ils ont vérifié que presque toutes changeaient rapidement à sa forme flagellée, par ce que le changement du système basé dans actina à l'autre de microtúbulos est hautement réglé et synchronisé dans toute la population.
Le génome de ce microorganisme révèle aussi comment il produit une énergie. Il peut utiliser de l'oxygène pour "brûler" des nutriments comme glucose ou des acides gras, ou, s'il n'y a pas d'oxygène, utiliser d'autres nutriments et routes métaboliques, en produisant l'hydrogène comme sous-produit. Ce dernier mécanisme lui permet de survivre à l'hipoxia dans l'atmosphère fangeuse où il vit. Un de ces experts spécule que peut-être cela peut servir à produire des biocombustibles si réussit à se comprendre bien cette dernière route métabolique.
La succession du génome de Naegleria est encore un pas. La comparative entre soi de plus de génomes de l'arbre évolutif des eucariotas nous aidera à comprendre l'évolution d'animaux plus complexes et à commencer à comprendre d'où venons nous. Parce que la science basique cherche à répondre seulement aux questions basiques habituelles : d'où venons-nous ?: quoi est-ce que nous sommes ?: adónde allons-nous ? … Ces hommes de science ont aidé un peu plus à éclaircir comment c'était le tataratatara … taratabuelo microbiano de vous, un amant lecteur.
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Des fontaines et des références :
Un communiqué de presse d'UC Berkeley avec vidéo.
Un article dans Cell (un résumé).